口腔健康、菌丛不良，以及它们与系统性健康及疾病的关连

对于人体微生物群、免疫系统及疾病之间的关连，我们在这方面的知识需要持续增长。肠道微生物群会影响我们身体健康及其功能，提升免疫系统功能及抑制病原体在体内繁殖。

肠道及中央神经系统之间的沟通是否良好对于我们整体健康有很重要的影响。健康的体内平衡（生态平衡）对于转化营养、维生素形成、免疫力耐受及肝脏与神经健康都是必须的。如果单食含有较多不健康的脂肪、精制碳水化合物及精致糖，会形成适合病原体生长的环境，这些病原体可以对抗氧化应激，并击败其他细菌，因此会改变微生物群的组合，导致病原性不平衡，又称为菌丛不良。菌丛不良发生后，会逐渐引起多种系统性及慢性疾病，例如大肠直肠癌、糖尿病、精神健康问题及自体免疫力疾病（例如系统性红斑狼疮症及类风湿性关节炎）。某些细菌载体可以引起肠胃道中表皮细胞的 DNA 受损、免疫系统失调、促炎性信号及分子相似。 菌丛不良可以先在口腔内发生（开始时是牙周病或牙髓感染），然后病原体会转移至其他部位。由口腔细菌产生的细胞因子可以到达呼吸道下端，从而导致肺炎；也可以到达其他较远的部位形成动脉粥样硬化斑块，以及复杂的细菌膜，与细菌膜表面有关的细菌群族可以在慢性感染是引致令人虚弱的症状。引起病原体迁移的因素包括：是否摄取足够营养、寄主的免疫接触、含氧量及体温。健康的肠道微生物群会产生短链脂肪酸（如醋酸盐及丁酸盐）以及其他能量来源，这些都可以令细胞及免疫力维持最佳状态。它们也可以直接与坏的肠胃道微生物群竞争营养及空间，因此可预防病原体繁殖。现时治疗菌丛不良的方法包括肠道微生物移植、益生菌、益生元及共生质。